L'objectif est d'améliorer le niveau de diagnostic des causes génétiques du raccourcissement fémoral fœtal (FL) et d'explorer la valeur de l'application conjointe du séquençage complet de l'exome (WES) et du dépistage des anomalies chromosomiques dans le diagnostic prénatal. Vingt-sept fœtus présentant un raccourcissement fémoral en milieu ou fin de grossesse [FL < 5e percentile selon l'âge gestationnel ou < -2 écarts-types (SD)] diagnostiqués au Centre de Diagnostic Prénatal et de Génétique Médicale de l'hôpital commémoratif Sun Yat-sen de l'Université Sun Yat-sen, de novembre 2023 à mai 2025, ont été inclus. Des échantillons de liquide amniotique ou de sang de cordon ont été prélevés pour analyse du caryotype chromosomique (19 cas), analyse par microarray chromosomique (CMA) ou séquençage génomique à faible profondeur (CNV-seq) (27 cas), ainsi que pour un séquençage complet exomique trio (Trio-WES) (27 cas). Les résultats ont été interprétés selon les lignes directrices de l’American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Parmi les 27 fœtus, 17 présentaient 26 variants génomiques, incluant des anomalies numériques chromosomiques (mosaïcisme), des variations du nombre de copies (CNV), des variants nucléotidiques simples (SNV) et des insertions/délétions (INDEL). Parmi ceux-ci, 11 cas avaient des variants expliquant le phénotype du raccourcissement fémoral, avec un taux de diagnostic global de 11/27, comprenant 9 cas avec des variants pathogènes/susceptibles, 1 variant de signification incertaine (VUS), et 1 cas d’anomalie numérique chromosomique (mosaïcisme) détectée par l’analyse du caryotype. Le taux de diagnostic par CNV (CMA/CNV-seq) était de 2/27, par WES de 10/27, avec une augmentation supplémentaire de 8/27 dans les cas négatifs ou incertains en CNV. Les variants identifiés comprenaient des mutations pathogènes associées aux gènes FGFR3, SHOX, DUOX2, CLCN5 et HBA1/HBA2. En conclusion, le Trio-WES améliore significativement le taux de diagnostic génétique du raccourcissement fémoral fœtal, particulièrement dans les cas où le dépistage chromosomique standard ne révèle pas la cause. L’analyse du caryotype reste capable de détecter des anomalies chromosomiques mosaïques à faible proportion, complétant efficacement le WES et la détection CNV. Il est recommandé d’adopter une stratégie de test génétique en escalier ou parallèle en diagnostic prénatal pour optimiser l’efficacité diagnostique et le soutien à la décision clinique.

séquençage complet de l'exome;variation du nombre de copies;raccourcissement fémoral;diagnostic prénatal;génétique