Использование последовательности cytb для идентификации инфекции Anisakis guangzhouensis в фекалиях полевых грызунов

LÜ Jinwei ,  

LIN Yu ,  

FENG Yaoyu ,  

XIAO Lihua ,  

YUAN Dongjuan ,  

摘要

Целью является применение различных молекулярных маркеров для оценки их эффективности в идентификации нематоды Anisakis guangzhouensis в фекалиях полевых грызунов из посёлка Хуашань округа Хуаду города Гуанчжоу, а также анализ состояния заражения грызунов. Метод: было поймано 128 полевых грызунов в посёлке Хуашань округа Хуаду города Гуанчжоу, собраны образцы их фекалий, из которых выделена общая ДНК с помощью набора FastDNA SPIN Kit for Soil. Было проведено ПЦР-амплифицирование генов cytb, cox I и ITS2, затем ампликоны секвенированы и подвергнуты филогенетическому анализу. Результаты: только 5 образцов показали однородные последовательности cytb без смешанных пиков, что позволяет точно идентифицировать Anisakis guangzhouensis. Результаты показали, что уровень заражённости бурых крыс Anisakis guangzhouensis составил 7,58% (5/66), в то время как у желтогрудных крыс, желтых полевых мышей, тенреков и зубчатокрыс последовательности cytb не обнаружены, что указывает на то, что бурые крысы являются подходящими хозяевами для Anisakis guangzhouensis, а последовательность cytb подходит для определения инфекции Anisakis guangzhouensis в фекалиях диких грызунов. Заключение: последовательность cytb является хорошим молекулярным маркером для определения присутствия Anisakis guangzhouensis в фекалиях полевых грызунов и может использоваться для долгосрочного мониторинга распространения и вредоносного потенциала этого паразита у грызунов.

关键词

Anisakis guangzhouensis;cytb;полевые грызуны;фекалии;исследование

阅读全文