Aplicación del secuenciamiento exómico familiar completo en el diagnóstico del acortamiento del fémur fetal

CHEN Manqi ,  

HUANG Zewei ,  

XU Qi ,  

ZHANG Shuning ,  

CHEN Xiaojun ,  

YAN Haiyan ,  

LI Xiang ,  

FU Shuai ,  

摘要

El objetivo es mejorar el nivel de diagnóstico de la etiología genética del acortamiento del fémur fetal (FL) y explorar el valor de la aplicación conjunta de secuenciación completa del exoma (WES) y detección de anormalidades cromosómicas en el diagnóstico prenatal. Se seleccionaron 27 fetos con acortamiento del fémur en el segundo y tercer trimestre [FL < percentil 5 para la edad gestacional o < -2 desviaciones estándar (SD)], atendidos en el Centro de Diagnóstico Prenatal y Genética Médica del Hospital Conmemorativo Sun Yat-sen de la Universidad Sun Yat-sen en Shenzhen desde noviembre de 2023 hasta mayo de 2025 como sujetos de estudio. Se recolectaron muestras de líquido amniótico o sangre del cordón umbilical para análisis de cariotipo cromosómico (19 casos), análisis de microarreglos cromosómicos (CMA) o secuenciación genómica de baja profundidad (CNV-seq) (27 casos) y se realizó secuenciación exómica tríada (Trio-WES) (27 casos). Los resultados se interpretaron de acuerdo con las directrices del Colegio Americano de Genética Médica y Genómica (ACMG). Entre los 27 fetos, se detectaron 26 variantes genómicas en 17 casos, incluyendo anormalidades numéricas cromosómicas (mosaicismo), variantes del número de copias (CNV), variantes de nucleótido único (SNV) e inserciones/deleciones (INDEL). De estos, las variantes genómicas detectadas en 11 casos pudieron explicar el fenotipo del acortamiento del fémur, con una tasa de diagnóstico global de 11/27; de estos, 9 casos se explicaron por variantes patogénicas/sospechosas, 1 caso por variantes de significado incierto (VUS) y 1 caso por anomalía numérica cromosómica (mosaicismo) detectada mediante análisis de cariotipo. La tasa de diagnóstico para CNV (CMA/CNV-seq) fue de 2/27, para WES fue de 10/27, con un aumento adicional en la tasa de diagnóstico de 8/27 en los casos con CNV negativo o incierto. Las variantes detectadas incluyen mutaciones patogénicas relacionadas con los genes FGFR3, SHOX, DUOX2, CLCN5 y HBA1/HBA2. Conclusión: El Trio-WES puede mejorar significativamente la tasa de diagnóstico genético para el acortamiento del fémur fetal, especialmente en casos en los que el análisis cromosómico convencional no puede determinar la causa. El análisis de cariotipo mantiene la capacidad de detectar anomalías cromosómicas mosaico a baja proporción, y puede complementar eficazmente el WES y la detección CNV. Se recomienda adoptar una estrategia de pruebas genéticas escalonada o paralela en el diagnóstico prenatal para optimizar la eficacia diagnóstica y el apoyo a la toma de decisiones clínicas.

关键词

secuenciación completa del exoma;variación del número de copias;acortamiento del fémur;diagnóstico prenatal;genética

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