语种选择
- For Author
- Articles & Issues
- Copyright & Ethics
- 个人中心
- 退出登录
浏览全部资源
扫码关注微信
- For Author
- Submission Instruction
- Manuscript Template
- Copyright Agreement
- Authors Statement Form
- Articles & Issues
- Just Accepted
- Latest Issue
- Archive
- Copyright & Ethics
- Open Access Statement
- Copyright Policy
- Ethics Statement
您当前的位置：
首页 >
文章列表页 >
Analysis of Clinicopathological Features in 12 Cases of BRG-1/INI-1-deficient Undifferentiated Tumors of the Digestive System
| 更新时间：2026-04-17
|
Analysis of Clinicopathological Features in 12 Cases of BRG-1/INI-1-deficient Undifferentiated Tumors of the Digestive System
- Journal of Sun Yat-sen University(Medical Sciences) Pages: 1-12(2026)
- 作者机构：
1.中山大学肿瘤防治中心内科，广东 广州 510060
2.中山大学肿瘤防治中心病理科，广东 广州 510060
- 作者简介：
LING Yihong， E-mail： lingyh@sysucc.org.cn
WEI Xiaoli， E-mail： weixl@sysucc.org.cn
- 基金信息：
DOI：10.11714/jsysu.med.YX20260023
CLC： R735Received：31 January 2026，
Revised：2026-03-09，
Accepted：25 March 2026，
Online First：17 April 2026，
- 稿件说明：
移动端阅览
ZHANG Kaiying, YANG Zhengjun, ZHAO Yiyang, et al. Analysis of Clinicopathological Features in 12 Cases of BRG-1/INI-1-deficient Undifferentiated Tumors of the Digestive System[J/OL]. Journal of Sun Yat-sen University(Medical Sciences), 2026, 1-12.
ZHANG Kaiying, YANG Zhengjun, ZHAO Yiyang, et al. Analysis of Clinicopathological Features in 12 Cases of BRG-1/INI-1-deficient Undifferentiated Tumors of the Digestive System[J/OL]. Journal of Sun Yat-sen University(Medical Sciences), 2026, 1-12. DOI： 10.11714/jsysu.med.YX20260023.
Analysis of Clinicopathological Features in 12 Cases of BRG-1/INI-1-deficient Undifferentiated Tumors of the Digestive System
摘要
目的
2
探讨
SMARCA4
（BRG1）与
SMARCB1
（INI-1）缺陷型消化道恶性肿瘤的临床病理学特征、分子图谱、治疗反应及预后，旨在提高对该类罕见且侵袭性强的分子亚型肿瘤的认识。
方法
2
本研究为单中心回顾性分析。纳入中山大学肿瘤防治中心2022年4月至2025年12月期间经病理确诊的9例BRG-1蛋白，3例INI-1蛋白表达缺失的消化系统恶性肿瘤病例，通过复习临床资料、组织学形态、免疫组织化学和部分病例的二代测序结果，系统总结其临床病理与分子特征，治疗策略及生存结局。
结果
2
12例患者中男性6例，女性6例，中位年龄62（44~70）岁。9例为
SMARCA4
缺失，3例为
SMARCB1
缺失。肿瘤原发于胃（5例）、结肠（3例）、胰腺（1例），另有3例原发灶不明。肿瘤组织学大多表现为未分化癌，1例表现为低分化癌，细胞呈上皮样，异型性显著。上皮标志物（如CKpan）表达常缺失或显著降低，而波形蛋白可为阳性。接受MMR状态检测的病例（9例）均保留错配修复功能（pMMR），Ki-67增殖指数高［中位数为80%（60%~90%）］。5例进行二代测序的病例中，免疫组化与基因突变一致性不佳。检测到的伴随突变包括
TP53、KRAS、NRAS
等，未见胚系突变。所有患者的中位随访时间为277（55~867） d。9/12的患者初诊时已为Ⅳ期。3例接受了治疗的初诊无转移患者中，有2例均获得了较长的无复发生存。初诊晚期患者主要接受以铂类为基础的化疗或联合方案，但预后普遍较差，总生存期较短，中位总生存期为60（45~541） d，范围为（16~867） d，个别接受化疗联合靶向及免疫治疗患者获得了较长的生存期。
结论
2
SMARCA4
/
SMARCB1
缺失型消化系统未分化肿瘤是一种高度侵袭、预后较差的独特分子亚型，多见于中老年患者，确诊依赖BRG-1/INI-1蛋白免疫组化缺失，目前治疗无标准方案，多参照原发部位腺癌的治疗经验。联合免疫及靶向治疗可能有效，需更大样本研究及前瞻性验证。
Abstract
Objective
2
To investigate the clinicopathological features， molecular profile， treatment response， and prognosis of
SMARCA4
（BRG-1） and
SMARCB1
（INI-1）-deficient undifferentiated tumors of the digestive system， aiming to enhance the understanding of this rare and highly aggressive molecular s
ubtype.
Methods
2
This study is a single-center retrospective analysis. We included 9 cases of malignant digestive system tumors with loss of BRG-1 （
SMARCA4
） expression and 3 cases with loss of INI-1
（SMARCB1
） expression， all pathologically confirmed at Sun Yat-sen University Cancer Center between April 2022 and December 2025. By reviewing clinical data， histological morphology， immunohistochemistry （testing for
SMARCA4
，
SMARCB1
， epithelial， mesenchymal， neuroendocrine markers， and mismatch repair proteins） and next-generation sequencing （NGS） results from 5 cases， we systematically summarized their clinicopathological and molecular characteristics， treatment strategies， and survival outcomes.
Results
2
Among the 12 patients， 6 were male and 6 were female， with a median age of 62 （44-70） years. 9 cases exhibited
SMARCA4
deficiency， and 3 cases exhibited
SMARCB1
deficiency. Tumors originated in the stomach （5 cases）， colon （3 cases）， pancreas （1 case）， with the primary site unknown in 3 cases. 9/12 of patients presented with stage Ⅳ disease at initial diagnosis. The histology predominantly showed undifferentiated carcinoma， with 1 case of poorly differentiated carcinoma. The tumor cells were epithelioid with significant atypia. Epithelial markers （e.g. CKpan） were often lost or markedly decreased， while vimentin could be positive. All 9 cases tested for MMR status were mismatch repair proficient （pMMR）， and the Ki-67 proliferation index was high ［median 80% （60%-90%）］. A discordance was observed between IHC findings and NGS results in the 5 sequenced cases. The NGS profiling revealed frequent co-occurring mutations， including
TP53， KRAS， and NRAS
， with no germline mutations identified.The median follow-up time was 277 （55-867） days. 9 of the 12 patients presented with stage Ⅳ disease at the time of initial diagnosis. Among 3 newly diagnos
ed patients without metastasis who received treatment， 2 achieved prolonged recurrence-free survival. Patients with advanced disease at initial diagnosis primarily underwent platinum-based chemotherapy or combination regimens， yet their prognosis was generally poor， with a median overall survival of 60 （45-541） days， ranging from 16 to 867 days. Notably， several patients who received chemotherapy combined with targeted therapy and immunotherapy achieved extended survival.
Conclusion
2
SMARCA4/SMARCB1
-deficient undifferentiated tumor of the digestive system is a distinct molecular subtype characterized by high aggressiveness and poor prognosis， predominantly affecting middle-aged and elderly individuals. Diagnosis relies on the immunohistochemical loss of BRG-1 or INI-1 proteins. While no standard of care currently exists， treatment often refers to regimens for adenocarcinoma of the primary site. Combined immunotherapy and targeted therapy may offer potential benefits， warranting further validation in large-scale prospective studies.
关键词
Keywords
references
Kadoch C ， Hargreaves DC ， Hodges C ， et al . Proteomic and bioinformatic analysis of mammalian SWI/SNF complexes identifies extensive roles in human malignancy ［J］. Nat Genet ， 2013 ， 45 （ 6 ）： 592 - 601 .
Valencia AM ， Sankar A ， van der Sluijs PJ ， et al . Landscape of mSWI/SNF chromatin remodeling complex perturbations in neurodevelopmental disorders ［J］. Nat Genet ， 2023 ， 55 （ 8 ）： 1400 - 1412 .
Malone HA ， Roberts CWM . Chromatin remodellers as therapeutic targets ［J］. Nat Rev Drug Discov ， 2024 ， 23 （ 9 ）： 661 - 681 .
Herpel E ， Rieker RJ ， Dienemann H ， et al . SMARCA4 and SMARCA2 deficiency in non-small cell lung cancer： immunohistochemical survey of 316 consecutive specimens ［J］. Ann Diagn Pathol ， 2017 ， 26 ： 47 - 51 .
Kadoch C ， Crabtree GR . Mammalian SWI/SNF chromatin remodeling complexes and cancer： Mechanistic insights gained from human genomics ［J］. Sci Adv ， 2015 ， 1 （ 5 ）： e1500447 .
Wens F ， Hulsker CCC ， Fiocco M ， et al . Small cell carcinoma of the ovary， hypercalcemic type （SCCOHT）： patient characteristics， treatment， and outcome-a systematic review ［J］. Cancers （Basel） ， 2023 ， 15 （ 15 ）： 3794 .
Cooper GW ， Hong AL . SMARCB1-deficient cancers： novel molecular insights and therapeutic vulnerabilities ［J］. Cancers （Basel） ， 2022 ， 14 （ 15 ）： 3645 .
Mackay A ， Burford A ， Carvalho D ， et al . Integrated molecular meta-analysis of 1，000 pediatric high-grade and diffuse intrinsic pontine glioma ［J］. Cancer Cell ， 2017 ， 32 （ 4 ）： 520 - 537 .
Le Loarer F ， Watson S ， Pierron G ， et al . SMARCA4 inactivation defines a group of undifferentiated thoracic malignancies transcriptionally related to BAF-deficient sarcomas ［J］. Nat Genet ， 2015 ， 47 （ 10 ）： 1200 - 1205 .
Liang X ， Gao X ， Wang F ， et al . Clinical characteristics and prognostic analysis of SMARCA4-deficient non-small cell lung cancer ［J］. Cancer Med ， 2023 ， 12 （ 13 ）： 14171 - 14182 .
Bell EH ， Chakraborty AR ， Mo X ， et al . SMARCA4/BRG1 is a novel prognostic biomarker predictive of cisplatin-based chemotherapy outcomes in resected non-small cell lung cancer ［J］. Clin Cancer Res ， 2016 ， 22 （ 10 ）： 2396 - 2404 .
Perret R ， Chalabreysse L ， Watson S ， et al . SMARCA4-deficient thoracic sarcomas： Clinicopathologic study of 30 cases with an emphasis on their nosology and differential diagnoses ［J］. Am J Surg Pathol ， 2019 ， 43 （ 4 ）： 455 - 465 .
Gastberger K ， Fincke VE ， Mucha M ， et al . Current molecular and clinical landscape of ATRT - the link to future therapies ［J］. Cancer Manag Res ， 2023 ， 15 ： 1369 - 1393 .
Gounder M ， Schöffski P ， Jones RL ， et al . Tazemetostat in advanced epithelioid sarcoma with loss of INI1/SMARCB1： an international， open-label， phase 2 basket study ［J］. Lancet Oncol ， 2020 ， 21 （ 11 ）： 1423 - 1432 .
Pugh TJ ， Bell JL ， Bruce JP ， et al . AACR Project GENIE： 100，000 cases and beyond ［J］. Cancer Discov ， 2022 ， 12 （ 9 ）： 2044 - 2057 .
Cornish AJ ， Gruber AJ ， Kinnersley B ， et al . The genomic landscape of 2，023 colorectal cancers ［J］. Nature ， 2024 ， 633 （ 8028 ）： 127 - 136 .
Saito-Adachi M ， Hama N ， Totoki Y ， et al . Oncogenic structural aberration landscape in gastric cancer genomes ［J］. Nat Commun ， 2023 ， 14 （ 1 ）： 3688 .
Varghese AM ， Perry MA ， Chou JF ， et al . Clinicogenomic landscape of pancreatic adenocarcinoma identifies KRAS mutant dosage as prognostic of overall survival ［J］. Nat Med ， 2025 ， 31 （ 2 ）： 466 - 477 .
The Cancer Genome Atlas Research Network . Comprehensive molecular characterization of gastric adenocarcinoma ［J］. Nature ， 2014 ， 513 （ 7517 ）： 202 - 209 .
Shi D ， Yang Z ， Cai Y ， et al . Research advances in the molecular classification of gastric cancer ［J］. Cell Oncol （Dordr） ， 2024 ， 47 （ 5 ）： 1523 - 1536 .
Liu M ， Sun T ， Li N ， et al . BRG1 attenuates colonic inflammation and tumorigenesis through autophagy-dependent oxidative stress sequestration ［J］. Nat Commun ， 2019 ， 10 （ 1 ）： 4614 .
Yan X ， Han D ， Chen Z ， et al . RUNX2 interacts with BRG1 to target CD44 for promoting invasion and migration of colorectal cancer cells ［J］. Cancer Cell Int ， 2020 ， 20 ： 505 .
Yavas A ， Ozcan K ， Adsay NV ， et al . SWI/SNF complex-deficient undifferentiated carcinoma of the pancreas： clinicopathologic and genomic analysis ［J］. Mod Pathol ， 2024 ， 37 （ 11 ）： 100585 .
Ma P ， Pan Y ， Yang F ， et al . KLF5-modulated lncRNA NEAT1 contributes to tumorigenesis by acting as a scaffold for BRG1 to silence GADD45A in gastric cancer ［J］. Mol Ther Nucleic Acids ， 2020 ， 22 ： 382 - 395 .
Hozumi C ， Iizuka A ， Ikeya T ， et al . Impact of mutations in subunit genes of the mammalian SWI/SNF complex on immunological tumor microenvironment ［J］. Cancer Genomics Proteomics ， 2024 ， 21 （ 1 ）： 88 - 101 .
WHO Classification of Tumours Editorial Board . Digestive system tumours： WHO classification of tumours， 5th edition， volume 1 ［M/OL］. Lyon ： International Agency for Research on Cancer ， 2019 ［ 2026-01-15 ］. https：//publications.iarc.who.int/Book-And-Report-Series/Who-Classification-Of-Tumours/Digestive-System-Tumours-2019 https://publications.iarc.who.int/Book-And-Report-Series/Who-Classification-Of-Tumours/Digestive-System-Tumours-2019 .
Amin MB ， Edge SB ， Greene FL ， et al . AJCC cancer staging manual （8th ed .） ［M］. New York ： Springer ， 2017 .
Strehl JD ， Wachter DL ， Fiedler J ， et al . Pattern of SMARCB1 （INI1） and SMARCA4 （BRG1） in poorly differentiated endometrioid adenocarcinoma of the uterus： analysis of a series with emphasis on a novel SMARCA4-deficient dedifferentiated rhabdoid variant ［J］. Ann Diagn Pathol ， 2015 ， 19 （ 4 ）： 198 - 202 .
Wang FH ， Zhang XT ， Li YF ， et al . The Chinese Society of Clinical Oncology （CSCO）： clinical guidelines for the diagnosis and treatment of gastric cancer， 2021 ［J］. Cancer Commun （Lond） ， 2021 ， 41 （ 8 ）： 747 - 795 .
Cibulskis K ， Lawrence MS ， Carter SL ， et al . Sensitive detection of somatic point mutations in impure and heterogeneous cancer samples ［J］. Nat Biotechnol ， 2013 ， 31 （ 3 ）： 213 - 219 .
Mardinian K ， Adashek JJ ， Botta GP ， et al . SMARCA4： implications of an altered chromatin-remodeling gene for cancer development and therapy ［J］. Mol Cancer Ther ， 2021 ， 20 （ 12 ）： 2341 - 2351 .
Fukuoka J ， Fujii T ， Shih JH ， et al . Chromatin remodeling factors and BRM/BRG1 expression as prognostic indicators in non-small cell lung cancer ［J］. Clin Cancer Res ， 2004 ， 10 （ 13 ）： 4314 - 4324 .
Medina PP ， Romero OA ， Kohno T ， et al . Frequent BRG1/SMARCA4-inactivating mutations in human lung cancer cell lines ［J］. Hum Mutat ， 2008 ， 29 （ 5 ）： 617 - 622 .
Wilson BG ， Roberts CW . SWI/SNF nucleosome remodellers and cancer ［J］. Nat Rev Cancer ， 2011 ， 11 （ 7 ）： 481 - 492 .
AACR Project GENIE Consortium . AACR Project GENIE： powering precision medicine through an international consortium ［J］. Cancer Discov ， 2017 ， 7 （ 8 ）： 818 - 831 .
朱培培 ， 李新星 ， 刘佳涵 ， 等 . 胃肠道SMARCA4缺失性未分化癌9例临床病理学分析 ［J］. 中华病理学杂志 ， 2022 ， 51 （ 9 ）： 868 - 874 .
Zhu PP ， Li XX ， Liu XH ， et al . SMARCA4-deficient undifferentiated carcinoma of the gastrointestinal tract： a clinicopathological and immunohistochemical study of 9 cases ［J］. Chin J Pathol ， 2022 ， 51 （ 9 ）： 868 - 874 .
赵雪莲 ， 孟丽丽 ， 章琼燕 ， 等 . SWI/SNF复合体缺失胃肠道肿瘤36例临床病理学分析 ［J］. 中华病理学杂志 ， 2024 ， 53 （ 3 ）： 269 - 275 .
Zhao XL ， Meng LL ， Zhang QY ， et al . Gastrointestinal tumors with SWI/SNF complex deficiency： a clinicopathological analysis of 36 cases ［J］. Chin J Pathol ， 2024 ， 53 （ 3 ）： 269 - 275 .
Ohta R ， Yamamoto N ， Tanaka K ， et al . Clinical characteristics and outcomes of SMARCA4-mutated or deficient malignancies： a systematic review of case reports and series ［J］. Cancers （Basel） ， 2025 ， 17 （ 16 ）： 2675 .
郭珊珊 ， 左晓丽 ， 曹璐璐 ， 等 . 原发性SMARCA4缺失的胆囊肉瘤一例 ［J］. 中华肝胆外科杂志 ， 2021 ， 27 （ 8 ）： 623 - 625 .
Guo SS ， Zuo XL ， Cao LL ， et al . Primary SMARCA4-deficient gallbladder sarcoma： a case report ［J］. Chin J Hepatobiliary Surg ， 2021 ， 27 （ 8 ）： 623 - 625 .
Deng XX ， Yang XH . Primary undifferentiated gallbladder carcinoma with SMARCA4 deletion： a case report and review of the literature ［J］. Int J Surg Pathol ， 2024 ， 32 （ 5 ）： 1017 - 1023 .
Chang B ， Sheng W ， Wang L ， et al . SWI/SNF complex-deficient undifferentiated carcinoma of the gastrointestinal tract： clinicopathologic study of 30 cases with an emphasis on variable morphology， immune features， and the prognostic significance of different SMARCA4 and SMARCA2 subunit deficiencies ［J］. Am J Surg Pathol ， 2022 ， 46 （ 7 ）： 889 - 906 .
Wang X ， Wang Y ， Xie M ， et al . Hypermethylation of CDKN2A CpG island drives resistance to PRC2 inhibitors in SWI/SNF loss-of-function tumors ［J］. Cell Death Dis ， 2024 ， 15 （ 11 ）： 794 .
Nakazato H ， Takeshima H ， Kishino T ， et al . Early-stage induction of SWI/SNF mutations during esophageal squamous cell carcinogenesis ［J］. PLoS One ， 2016 ， 11 （ 1 ）： e0147372 .
Dermawan JK ， Singer S ， Tap WD ， et al . The genetic landscape of SMARCB1 alterations in SMARCB1-deficient spectrum of mesenchymal neoplasms ［J］. Mod Pathol ， 2022 ， 35 （ 12 ）： 1900 - 1909 .
Lin Y ， Yu B ， Sun H ， et al . Promising efficacy of immune checkpoint inhibitor plus chemotherapy for thoracic SMARCA4-deficient undifferentiated tumor ［J］. J Cancer Res Clin Oncol ， 2023 ， 149 （ 11 ）： 8663 - 8671 .
Wang D ， Wang J ， Zhou D ， et al . SWI/SNF complex genomic alterations as a predictive biomarker for response to immune checkpoint inhibitors in multiple cancers ［J］. Cancer Immunol Res ， 2023 ， 11 （ 5 ）： 646 - 656 .
Botta GP ， Kato S ， Patel H ， et al . SWI/SNF complex alterations as a biomarker of immunotherapy efficacy in pancreatic cancer ［J］. JCI Insight ， 2021 ， 6 （ 18 ）： e150453 .
查看原文
0
Views
0
下载量
0
CSCD
Alert me when the article has been cited
文章被引用时，请邮件提醒。
提交
Tools
Download
- L-PDFDownload
- Meta-XMLDownload
Export Citation
- BibTeXDownload
- EndnoteDownload
- RefMan Download
- NoteExpressDownload
- NoteFirstDownload
Share
Share with wechat friends or circle of friends
Add to favorites
Add to my album
Publicity Resources
Related Articles
RBMS3 Expression and Its Correlation with Clinicopathological Features and Prognosis of Epithelial Ovarian Cancer
Related Author
XING Rui-li
YIN Tian
FAN Fang-tian
ZHANG Ying
ZHANG Qing-song
YANG Bo
Related Institution
Department of Gynecology, The First Affiliated Hospital of Bengbu Medical College
College of Pharmacy, Bengbu Medical College
Anhui Engineering Technology Research Center of Biochemical Pharmaceutical
选择翻译语言
- Postal code：510080
- Tel：020-87690764，87690974，87690694 Email：xbmed@mail.sysu.edu.cn
- Technical support is provided by Beijing Founder electronics co., LTD 京ICP备09064830号-19
京公网安备11010802024621 - It is recommended to read the content of this site in Chrome&IE9+. Please switch to extreme mode in browser 360.
- Cookies We use cookies to help provide and enhance our service and tailor content. By continuing, you agree to the use of cookies.
0
Bulk Citation
Export to
BibTeXEndnoteRefManNoteExpressNoteFirst
TOP