SNP基因芯片结合多重置换扩增技术检测单细胞 非整倍体的研究

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SNP基因芯片结合多重置换扩增技术检测单细胞非整倍体的研究

更新时间：2023-12-08

- SNP基因芯片结合多重置换扩增技术检测单细胞非整倍体的研究
- Detection of Aneuploidy from Single Cells by Array-Comparative Genetic Hybridization
- 中山大学学报（医学科学版） 2009年30卷第4期
- 作者机构：
- 作者简介：
- 基金信息：
- DOI：
  中图分类号： R711.6
- 网络首发：2009-07-20，
  
  纸质出版：2009
- 稿件说明：
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SNP基因芯片结合多重置换扩增技术检测单细胞非整倍体的研究[J]. 中山大学学报（医学科学版）, 2009,30(4).

Detection of Aneuploidy from Single Cells by Array-Comparative Genetic Hybridization[J]. Journal of Sun Yat-sen University (Medical Sciences), 2009, 30(4).
SNP基因芯片结合多重置换扩增技术检测单细胞非整倍体的研究[J]. 中山大学学报（医学科学版）, 2009,30(4). DOI：

Detection of Aneuploidy from Single Cells by Array-Comparative Genetic Hybridization[J]. Journal of Sun Yat-sen University (Medical Sciences), 2009, 30(4). DOI：

【目的】建立并优化利用微阵列-比较基因组杂交技术检测单细胞非整倍体的实验方案65377; 【方法】纤维母细胞系GM02732(47

+18)和GM00343[46

4(del) (qter > p14)]被用于实验65377;阳性对照组为上述细胞系的基因组DNA(gDNA)(A组与B组

n = 6);实验组为单细胞模板的多重置换扩增(MDA)产物(C组与D组

n = 10);阴性对照组为空白对照的MDA产物(E组

n = 6)65377;以上样本与10 k 2.0基因分型芯片杂交并进行染色体拷贝数分析

比较利用非扩增的正常gDNA和同法扩增的DNA(MDA-DNA)作为分析参照对C组和D组的结果准确度的影响65377;【结果】 A→E组的芯片杂交信号判读率分别为98.7%65380;97.2%65380;86.7%65380;85.9%与3.2%65377;利用单细胞MDA-DNA作为参照时

C组与D组杂交信号的变异程度明显小于使用gDNA作为参照时(P < 0.05)65377;利用CNAT分析软件

发现以gDNA作为参照时

C组与D组部分染色体优势扩增明显

而使用MDA-DNA作为参照时则未观察到类似现象65377; 【结论】结合MDA和基因芯片平台对单细胞进行非整倍体检测时应使用同法扩增的DNA作为分析参照65377;

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